試管嬰兒治療的時候，有些情況下男方不能親自前來取精，可能是因為某些原因，也有可能是睾丸穿刺取精失敗或其他意外情況導緻取精失敗。為了盡量減少女方的損失，就需要先把卵子冷凍起來保存起來，等男方的精子準備好了再解凍卵子進行試管嬰兒的程序。在試管嬰兒治療過程中，如果有多餘的卵子，也可以冷凍保存起來，以備不時之需。如果卵子受精失敗或者懷孕沒有成功，就可以再次使用冷凍的卵子，這樣就能避免再次進行促排卵和取卵手術，減少對患者的傷害。對於通過試管嬰兒成功懷孕的女性來說，保存冷凍的卵子也可以是將來的備用，或者捐贈給沒有可用卵子的人。此外，冷凍卵子還可以幫助那些患有可能導緻卵巢功能喪失的盆腔腫瘤等疾病的女性保留生育能力。全世界的生殖醫學中心都在研究卵子冷凍保存技術，有一些已經成功將冷凍的卵子用於試管嬰兒並順利分娩，但是冷凍卵子進行試管嬰兒的臨床妊娠率差異很大，範圍在2.5％～62.0%之間。